Alle fünf Jahre wählen die IHK-zugehörigen Unternehmen die Vollversammlung. Im Mai 2011 waren alle 360.000 IHK-zugehörigen Unternehmen aufgerufen, in allgemeiner, freier, gleicher und geheimer Wahl ihr neues „Parlament der Wirtschaft“ in Oberbayern zu bestimmen. Gleichzeitig wurden in den Landkreisen außerhalb Münchens die Mitglieder der 14 IHK-Gremien gewählt.

Die Vollversammlung ist das wichtigste Organ der IHK. In ihr sind die Kompetenz und der Sachverstand aller Wirtschaftszweige und Branchen aus kleinen, mittleren und großen Unternehmen vereint. Sie entscheidet über die Ausrichtung und das Angebot der IHK und nicht zuletzt auch über den Haushalt und damit die Höhe der Beiträge. Sie wird dabei beratend durch die IHK-Gremiumsausschüsse unterstützt.